Home / Gene

HSD17B11

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near HSD17B11

chr4:87,236,515..87,491,188, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

Variant Position PXR FXR AhR AF
chr4_87278458_A_Tchr4:87278458-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Achr4:87278461-1.000-1.000-1.000<0.001%
chr4_87278457_C_Achr4:87278457-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278459_A_Cchr4:87278459-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Cchr4:87278461-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Tchr4:87278461-1.000-1.000-1.0000.0013%
chr4_87278464_C_Achr4:87278464-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278458_A_Cchr4:87278458-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278457_C_Gchr4:87278457-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278460_A_Cchr4:87278460-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278436_T_Achr4:872784361.0001.0001.000—   
chr4_87278454_G_Cchr4:87278454-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278462_T_Cchr4:87278462-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278457_C_Tchr4:87278457-0.996-1.000-1.000—   
chr4_87278464_C_Gchr4:87278464-0.970-1.000-1.000—   
chr4_87278459_A_Tchr4:87278459-0.956-1.000-1.000—   
chr4_87278464_C_Tchr4:87278464-0.918-1.000-1.000—   
chr4_87278454_G_Achr4:87278454-0.862-1.000-1.000—   
chr4_87278460_A_Tchr4:87278460-0.828-1.000-1.0000.0020%
chr4_87278459_A_Gchr4:87278459-0.803-1.000-1.000—   
chr4_87278436_T_Gchr4:872784360.7951.0000.724—   
chr4_87278473_G_Tchr4:87278473-0.772-0.995-1.000—   
chr4_87278462_T_Achr4:87278462-0.705-1.000-1.000—   
chr4_87278430_A_Tchr4:87278430-0.691-1.000-1.000—   
chr4_87278465_T_Gchr4:872784650.6790.9590.665—   
chr4_87278458_A_Gchr4:87278458-0.637-1.000-0.812—   
chr4_87278463_T_Gchr4:87278463-0.609-0.871-0.718—   
chr4_87278454_G_Tchr4:87278454-0.606-1.000-0.874<0.001%
chr4_87278448_G_Tchr4:87278448-0.586-0.967-0.850—   
chr4_87278456_T_Cchr4:87278456-0.586-1.000-0.788—   
chr4_87278474_A_Tchr4:872784740.4940.6520.282—   
chr4_87278436_T_Cchr4:87278436-0.491-1.000-0.818—   
chr4_87278460_A_Gchr4:87278460-0.485-0.860-0.721—   
chr4_87278446_C_Achr4:87278446-0.463-0.774-0.624—   
chr4_87278463_T_Cchr4:872784630.4610.5380.471—   
chr4_87278455_A_Cchr4:87278455-0.449-0.708-0.494—   
chr4_87278465_T_Achr4:872784650.4380.6420.306—   
chr4_87278474_A_Cchr4:872784740.4380.6290.353—   
chr4_87278398_C_Gchr4:872783980.4310.6020.518—   
chr4_87278473_G_Achr4:87278473-0.393-0.594-0.494—   
chr4_87278456_T_Achr4:87278456-0.385-0.660-0.435—   
chr4_87278411_C_Achr4:87278411-0.381-0.706-0.541—   
chr4_87278470_A_Cchr4:87278470-0.376-0.596-0.512—   
chr4_87278432_G_Achr4:87278432-0.375-0.690-0.524<0.001%
chr4_87278439_G_Tchr4:87278439-0.349-0.497-0.371—   
chr4_87278453_G_Tchr4:87278453-0.348-0.673-0.388—   
chr4_87278439_G_Achr4:87278439-0.344-0.668-0.418—   
chr4_87278443_T_Gchr4:872784430.3340.3930.335—   
chr4_87278450_A_Cchr4:872784500.3290.5200.294—   
chr4_87278451_A_Cchr4:872784510.3240.4850.335—   
chr4_87278475_A_Tchr4:872784750.3230.2160.124—   
chr4_87278399_T_Gchr4:872783990.3190.3860.347—   
chr4_87278434_G_Cchr4:87278434-0.318-0.602-0.476—   
chr4_87278441_T_Gchr4:872784410.3090.5480.288—   
chr4_87278419_A_Gchr4:87278419-0.304-0.475-0.253—   
chr4_87278466_T_Cchr4:872784660.2980.4370.329—   
chr4_87278400_T_Gchr4:872784000.2910.4210.335—   
chr4_87278415_T_Achr4:87278415-0.291-0.574-0.435<0.001%
chr4_87278398_C_Achr4:872783980.2830.3580.329—   
chr4_87278451_A_Gchr4:87278451-0.281-0.442-0.388—   
chr4_87278389_A_Tchr4:872783890.1380.2890.494—   
chr4_87278386_G_Achr4:872783860.2630.5360.488—   
chr4_87279502_A_Gchr4:87279502-0.082-0.315-0.488—   
chr4_87278468_A_Cchr4:87278468-0.274-0.391-0.353—   
chr4_87278473_G_Cchr4:87278473-0.271-0.371-0.418—   
chr4_87278409_C_Tchr4:87278409-0.266-0.477-0.300—   
chr4_87278431_T_Gchr4:87278431-0.265-0.566-0.441—   
chr4_87278437_T_Achr4:87278437-0.261-0.515-0.324—   
chr4_87278438_T_Cchr4:872784380.2600.3320.365—   
chr4_87278447_T_Cchr4:872784470.2600.3730.329—   
chr4_87278452_G_Achr4:87278452-0.251-0.421-0.376—   
chr4_87278416_G_Achr4:872784160.2500.1620.018—   
chr4_87278419_A_Cchr4:872784190.1650.7590.118—   
chr4_87278405_T_Achr4:87278405-0.245-0.383-0.271—   
chr4_87278387_A_Tchr4:872783870.2430.2890.188—   
chr4_87278405_T_Gchr4:87278405-0.243-0.335-0.206—   
chr4_87278367_C_Tchr4:872783670.2410.2510.241—   
chr4_87278389_A_Cchr4:87278389-0.240-0.391-0.212—   
chr4_87278368_C_Gchr4:872783680.2380.1730.159—   
chr4_87278383_T_Achr4:87278383-0.238-0.332-0.341—   
chr4_87278371_C_Achr4:872783710.2360.3350.235—   
chr4_87278407_A_Gchr4:87278407-0.231-0.398-0.306—   
chr4_87278396_T_Gchr4:872783960.2300.3930.276—   
chr4_87278408_A_Tchr4:87278408-0.228-0.482-0.312—   
chr4_87278404_G_Cchr4:87278404-0.226-0.360-0.321—   
chr4_87278432_G_Tchr4:872784320.2250.3730.247—   
chr4_87278456_T_Gchr4:87278456-0.216-0.312-0.212—   
chr4_87278342_A_Gchr4:87278342-0.215-0.152-0.041—   
chr4_87278370_A_Cchr4:87278370-0.215-0.157-0.1710.0020%
chr4_87278368_C_Achr4:872783680.2130.1470.124—   
chr4_87278387_A_Cchr4:872783870.2130.2840.194—   
chr4_87278415_T_Cchr4:87278415-0.211-0.358-0.259—   
chr4_87278403_T_Achr4:87278403-0.210-0.084-0.100—   
chr4_87278406_G_Tchr4:87278406-0.208-0.386-0.271—   
chr4_87278368_C_Tchr4:872783680.2060.1290.141<0.001%
chr4_87278425_G_Tchr4:87278425-0.206-0.198-0.176—   
chr4_87278462_T_Gchr4:872784620.2060.4800.182—   
chr4_87278472_C_Achr4:872784720.2050.3600.165—   
chr4_87278400_T_Cchr4:872784000.2030.2820.194—   
chr4_87278468_A_Gchr4:872784680.2000.3220.300—   
chr4_87278390_A_Gchr4:87278390-0.198-0.185-0.188—   
chr4_87278406_G_Cchr4:87278406-0.198-0.419-0.329—   
chr4_87278408_A_Gchr4:87278408-0.198-0.386-0.229—   
chr4_87278419_A_Tchr4:87278419-0.198-0.211-0.182—   
chr4_87278422_T_Gchr4:872784220.1980.3880.300—   
chr4_87278467_C_Achr4:87278467-0.196-0.206-0.271—   
chr4_87278471_C_Tchr4:87278471-0.195-0.345-0.224—   
chr4_87278450_A_Tchr4:87278450-0.057-0.274-0.341—   
chr4_87278369_C_Tchr4:87278369-0.190-0.028-0.018<0.001%
chr4_87278463_T_Achr4:87278463-0.190-0.236-0.200—   
chr4_87278469_C_Achr4:872784690.1900.4290.229—   
chr4_87278424_T_Gchr4:872784240.1850.3430.312—   
chr4_87278447_T_Achr4:87278447-0.183-0.203-0.282—   
chr4_87278366_T_Cchr4:872783660.1780.0740.041—   
chr4_87278367_C_Gchr4:872783670.1780.1190.106—   
chr4_87278409_C_Gchr4:87278409-0.173-0.266-0.094—   
chr4_87278446_C_Gchr4:87278446-0.173-0.239-0.212—   
chr4_87278435_T_Gchr4:87278435-0.171-0.338-0.276—   
chr4_87278439_G_Cchr4:87278439-0.171-0.099-0.106—   
chr4_87278402_G_Tchr4:872784020.1700.1680.153—   
chr4_87278422_T_Cchr4:87278422-0.170-0.317-0.265<0.001%
chr4_87278383_T_Gchr4:87278383-0.168-0.368-0.271—   
chr4_87278400_T_Achr4:872784000.1660.1240.118—   
chr4_87278397_C_Gchr4:872783970.1630.1880.200—   
chr4_87278339_T_Gchr4:87278339-0.160-0.168-0.047—   
chr4_87278421_C_Achr4:87278421-0.160-0.043-0.035—   
chr4_87278431_T_Cchr4:872784310.1580.2790.135<0.001%
chr4_87278448_G_Cchr4:87278448-0.158-0.264-0.241—   
chr4_87278388_A_Cchr4:87278388-0.128-0.330-0.276—   
chr4_87278402_G_Cchr4:872784020.1560.1750.153—   
chr4_87278367_C_Achr4:872783670.1550.0610.041<0.001%
chr4_87278429_A_Tchr4:87278429-0.155-0.246-0.265—   
chr4_87278395_T_Gchr4:872783950.1530.2210.106—   
chr4_87278428_C_Achr4:87278428-0.153-0.162-0.171—   
chr4_87278444_T_Cchr4:872784440.1530.2640.165—   
chr4_87278467_C_Gchr4:872784670.1530.3320.135—   
chr4_87278409_C_Achr4:87278409-0.151-0.231-0.082<0.001%
chr4_87278396_T_Achr4:872783960.1500.1450.024—   
chr4_87278410_C_Achr4:87278410-0.150-0.299-0.147—   
chr4_87278366_T_Achr4:872783660.1460.0180.006—   
chr4_87278412_A_Gchr4:87278412-0.146-0.030-0.082—   
chr4_87278420_C_Gchr4:87278420-0.146-0.256-0.159—   
chr4_87278366_T_Gchr4:872783660.1450.0000.024—   
chr4_87278434_G_Achr4:87278434-0.126-0.442-0.2240.0039%
chr4_87278434_G_Tchr4:87278434-0.145-0.365-0.171—   
chr4_87278358_A_Tchr4:872783580.1430.018-0.035—   
chr4_87278399_T_Cchr4:872783990.1430.2260.135—   
chr4_87278438_T_Achr4:87278438-0.131-0.236-0.253—   
chr4_87278363_A_Tchr4:872783630.141-0.043-0.018—   
chr4_87278388_A_Gchr4:87278388-0.085-0.213-0.250—   
chr4_87278448_G_Achr4:87278448-0.141-0.228-0.218—   
chr4_87278444_T_Achr4:87278444-0.140-0.129-0.159—   
chr4_87278449_A_Cchr4:872784490.1400.2560.053—   
chr4_87278371_C_Tchr4:87278371-0.138-0.0660.0060.0026%
chr4_87278364_T_Gchr4:872783640.1360.008-0.006—   
chr4_87278418_C_Gchr4:87278418-0.136-0.266-0.218—   
chr4_87278453_G_Cchr4:87278453-0.136-0.322-0.088—   
chr4_87278466_T_Achr4:872784660.1360.1880.129—   
chr4_87278471_C_Gchr4:872784710.1350.3100.188<0.001%
chr4_87278410_C_Gchr4:87278410-0.133-0.338-0.112—   
chr4_87278393_T_Cchr4:87278393-0.1310.038-0.094<0.001%
chr4_87278378_T_Cchr4:872783780.1300.0610.100—   
chr4_87278389_A_Gchr4:87278389-0.130-0.236-0.224—   
chr4_87278392_A_Cchr4:872783920.1280.2640.206—   
chr4_87278397_C_Achr4:872783970.1280.1620.129—   
chr4_87278408_A_Cchr4:872784080.0850.3880.118—   
chr4_87278468_A_Tchr4:872784680.1270.2230.171—   
chr4_87278358_A_Gchr4:872783580.125-0.036-0.041—   
chr4_87278364_T_Achr4:872783640.125-0.030-0.065—   
chr4_87278374_T_Gchr4:872783740.1250.1520.171—   
chr4_87278381_A_Tchr4:87278381-0.125-0.122-0.141—   
chr4_87278452_G_Cchr4:87278452-0.125-0.282-0.212—   
chr4_87278359_G_Cchr4:872783590.0900.1240.218—   
chr4_87278403_T_Cchr4:872784030.1230.1290.118—   
chr4_87278429_A_Cchr4:872784290.1150.3730.212—   
chr4_87278342_A_Tchr4:87278342-0.121-0.061-0.047—   
chr4_87278363_A_Cchr4:872783630.121-0.102-0.076—   
chr4_87278431_T_Achr4:872784310.1210.2030.065—   
chr4_87278440_A_Tchr4:872784400.1000.3710.165—   
chr4_87278386_G_Tchr4:872783860.1200.2210.159—   
chr4_87278418_C_Achr4:87278418-0.118-0.241-0.135—   
chr4_87278455_A_Tchr4:872784550.1180.1850.124—   
chr4_87278371_C_Gchr4:872783710.1160.1550.118—   
chr4_87278393_T_Gchr4:87278393-0.116-0.104-0.124—   
chr4_87278414_A_Tchr4:87278414-0.116-0.236-0.1650.0020%
chr4_87278425_G_Achr4:87278425-0.116-0.249-0.135—   
chr4_87278376_T_Achr4:872783760.1150.1470.165—   
chr4_87278406_G_Achr4:87278406-0.115-0.201-0.159—   
chr4_87278407_A_Tchr4:872784070.1150.0430.041—   
chr4_87278429_A_Gchr4:872784290.1150.1930.082—   
chr4_87278443_T_Cchr4:87278443-0.115-0.198-0.176—   
chr4_87278418_C_Tchr4:87278418-0.078-0.348-0.176—   
chr4_87278363_A_Gchr4:872783630.113-0.076-0.035<0.001%
chr4_87278403_T_Gchr4:872784030.1130.0960.053—   
chr4_87278441_T_Cchr4:872784410.1130.1900.076—   
chr4_87278472_C_Gchr4:872784720.0980.3250.200—   
chr4_87278390_A_Tchr4:87278390-0.111-0.249-0.165—   
chr4_87278358_A_Cchr4:872783580.110-0.079-0.082—   
chr4_87278373_C_Tchr4:87278373-0.110-0.127-0.106—   
chr4_87278382_C_Tchr4:87278382-0.093-0.282-0.194—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the p99-scaled [−1, 1] value; click a column to sort.