Home / Gene

PPP6R2

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near PPP6R2

chr22:50,243,326..50,545,089, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

Variant Position PXR FXR AhR AF
chr22_50245056_G_Cchr22:50245056-0.006-0.296-1.000—   
chr22_50245055_C_Gchr22:50245055-0.141-0.221-1.000—   
chr22_50244864_T_Cchr22:502448640.5790.1681.000—   
chr22_50245056_G_Tchr22:502450560.105-0.261-1.000—   
chr22_50245055_C_Tchr22:50245055-0.229-0.273-0.935—   
chr22_50245055_C_Achr22:50245055-0.148-0.282-0.829—   
chr22_50245053_T_Achr22:50245053-0.227-0.199-0.771—   
chr22_50245051_A_Gchr22:50245051-0.210-0.259-0.765—   
chr22_50245050_A_Cchr22:50245050-0.145-0.255-0.747—   
chr22_50245114_G_Cchr22:50245114-0.164-0.201-0.741—   
chr22_50245050_A_Gchr22:50245050-0.197-0.256-0.706—   
chr22_50245108_A_Cchr22:50245108-0.220-0.193-0.671—   
chr22_50245056_G_Achr22:50245056-0.113-0.124-0.659—   
chr22_50245076_G_Achr22:50245076-0.003-0.0340.659—   
chr22_50245054_A_Cchr22:50245054-0.296-0.177-0.635—   
chr22_50245044_C_Gchr22:50245044-0.250-0.251-0.629—   
chr22_50245059_A_Tchr22:50245059-0.054-0.208-0.629—   
chr22_50245062_G_Tchr22:50245062-0.354-0.048-0.012—   
chr22_50245053_T_Gchr22:50245053-0.208-0.136-0.618—   
chr22_50244832_G_Cchr22:502448320.0230.1520.600—   
chr22_50244842_A_Tchr22:50244842-0.0180.0380.600—   
chr22_50245054_A_Tchr22:50245054-0.259-0.128-0.600—   
chr22_50245114_G_Achr22:50245114-0.093-0.208-0.600—   
chr22_50244816_T_Achr22:502448160.2510.0960.588—   
chr22_50245079_T_Gchr22:50245079-0.329-0.126-0.506—   
chr22_50244789_C_Achr22:502447890.2330.2640.576—   
chr22_50245057_T_Gchr22:502450570.121-0.209-0.559—   
chr22_50244990_C_Achr22:502449900.3140.1640.247—   
chr22_50244790_C_Tchr22:502447900.2010.3100.553—   
chr22_50244857_G_Tchr22:502448570.2180.1850.553—   
chr22_50245111_T_Cchr22:50245111-0.205-0.243-0.553—   
chr22_50244857_G_Cchr22:502448570.1880.1780.541—   
chr22_50245050_A_Tchr22:50245050-0.062-0.157-0.529—   
chr22_50245059_A_Gchr22:50245059-0.037-0.211-0.529—   
chr22_50245049_G_Cchr22:50245049-0.124-0.153-0.512—   
chr22_50245051_A_Cchr22:50245051-0.258-0.178-0.506—   
chr22_50245083_G_Tchr22:50245083-0.150-0.069-0.506—   
chr22_50245109_C_Achr22:50245109-0.285-0.187-0.506—   
chr22_50245052_A_Cchr22:50245052-0.154-0.160-0.482—   
chr22_50245118_T_Achr22:502451180.2700.0970.141—   
chr22_50244864_T_Achr22:502448640.1810.1070.471—   
chr22_50245057_T_Achr22:502450570.088-0.145-0.459—   
chr22_50245083_G_Achr22:50245083-0.115-0.073-0.459—   
chr22_50245111_T_Achr22:50245111-0.189-0.221-0.459—   
chr22_50245112_C_Achr22:50245112-0.107-0.182-0.447—   
chr22_50245115_G_Achr22:50245115-0.136-0.108-0.447—   
chr22_50245048_G_Cchr22:50245048-0.152-0.129-0.441—   
chr22_50245057_T_Cchr22:502450570.034-0.144-0.441—   
chr22_50245059_A_Cchr22:50245059-0.003-0.223-0.441—   
chr22_50245045_G_Cchr22:50245045-0.185-0.123-0.429—   
chr22_50245058_C_Gchr22:50245058-0.153-0.146-0.429—   
chr22_50244967_A_Tchr22:502449670.2330.0990.176—   
chr22_50245082_A_Cchr22:50245082-0.233-0.0030.094—   
chr22_50245108_A_Tchr22:50245108-0.162-0.122-0.412—   
chr22_50245110_T_Cchr22:50245110-0.089-0.211-0.412—   
chr22_50245058_C_Tchr22:50245058-0.050-0.112-0.406—   
chr22_50245079_T_Achr22:502450790.2290.051-0.200—   
chr22_50245008_A_Cchr22:502450080.086-0.163-0.400—   
chr22_50245008_A_Tchr22:502450080.092-0.129-0.400—   
chr22_50245053_T_Cchr22:50245053-0.203-0.121-0.400—   
chr22_50244975_C_Achr22:502449750.2230.1190.012—   
chr22_50244969_A_Cchr22:502449690.220-0.0090.318—   
chr22_50245006_T_Cchr22:502450060.054-0.164-0.388—   
chr22_50245111_T_Gchr22:50245111-0.117-0.237-0.388—   
chr22_50244965_G_Cchr22:502449650.2180.010-0.035—   
chr22_50245038_C_Tchr22:50245038-0.216-0.117-0.265—   
chr22_50245044_C_Achr22:50245044-0.160-0.141-0.382—   
chr22_50245049_G_Achr22:502450490.023-0.053-0.382—   
chr22_50245112_C_Gchr22:50245112-0.098-0.185-0.376—   
chr22_50245006_T_Achr22:502450060.026-0.104-0.371—   
chr22_50245079_T_Cchr22:50245079-0.186-0.060-0.365—   
chr22_50244961_C_Gchr22:50244961-0.205-0.0810.082—   
chr22_50245029_G_Cchr22:50245029-0.205-0.038-0.112—   
chr22_50245048_G_Tchr22:50245048-0.098-0.086-0.359—   
chr22_50245004_C_Gchr22:502450040.2000.012-0.135—   
chr22_50245005_G_Achr22:50245005-0.021-0.146-0.353—   
chr22_50245006_T_Gchr22:502450060.022-0.155-0.353—   
chr22_50245022_G_Tchr22:50245022-0.097-0.026-0.353—   
chr22_50245112_C_Tchr22:50245112-0.122-0.169-0.353—   
chr22_50245005_G_Tchr22:50245005-0.012-0.157-0.341—   
chr22_50244816_T_Gchr22:502448160.0730.0380.329—   
chr22_50245002_C_Tchr22:502450020.0190.1990.329—   
chr22_50245004_C_Achr22:50245004-0.042-0.143-0.329—   
chr22_50245005_G_Cchr22:502450050.026-0.173-0.329—   
chr22_50245043_G_Tchr22:50245043-0.168-0.117-0.329—   
chr22_50245115_G_Tchr22:50245115-0.078-0.069-0.329—   
chr22_50244866_C_Tchr22:50244866-0.075-0.117-0.318—   
chr22_50245110_T_Gchr22:50245110-0.156-0.199-0.318—   
chr22_50245113_C_Gchr22:50245113-0.111-0.190-0.318—   
chr22_50245043_G_Cchr22:50245043-0.161-0.143-0.312—   
chr22_50244837_C_Gchr22:502448370.0300.0840.306—   
chr22_50244839_A_Cchr22:50244839-0.103-0.069-0.306—   
chr22_50244961_C_Achr22:502449610.067-0.1510.306—   
chr22_50245086_G_Cchr22:502450860.0630.0540.306—   
chr22_50245105_C_Achr22:50245105-0.0310.003-0.306—   
chr22_50245040_G_Cchr22:50245040-0.137-0.088-0.300—   
chr22_50245042_C_Achr22:50245042-0.168-0.055-0.235—   
chr22_50245046_C_Gchr22:50245046-0.168-0.107-0.224—   
chr22_50245018_C_Gchr22:50245018-0.167-0.077-0.153—   
chr22_50244863_G_Achr22:50244863-0.050-0.109-0.294—   
chr22_50244939_C_Gchr22:502449390.1000.0290.294—   
chr22_50244966_G_Cchr22:502449660.1660.0090.024—   
chr22_50245081_A_Cchr22:502450810.058-0.0030.294—   
chr22_50245083_G_Cchr22:502450830.1650.1210.294—   
chr22_50245107_T_Gchr22:50245107-0.101-0.040-0.294—   
chr22_50245046_C_Achr22:50245046-0.166-0.078-0.288—   
chr22_50245070_G_Cchr22:50245070-0.161-0.041-0.188—   
chr22_50245072_C_Achr22:50245072-0.1610.0430.071—   
chr22_50244823_C_Gchr22:50244823-0.030-0.0630.282—   
chr22_50244866_C_Achr22:50244866-0.050-0.096-0.282—   
chr22_50244900_G_Cchr22:502449000.0770.0380.282—   
chr22_50244965_G_Achr22:502449650.1600.056-0.024—   
chr22_50245110_T_Achr22:50245110-0.051-0.074-0.282—   
chr22_50244965_G_Tchr22:502449650.1580.049-0.106—   
chr22_50244978_G_Tchr22:502449780.1570.0430.024—   
chr22_50244993_C_Gchr22:502449930.1570.0470.212—   
chr22_50245038_C_Gchr22:50245038-0.048-0.016-0.276—   
chr22_50245048_G_Achr22:502450480.050-0.022-0.276—   
chr22_50245033_T_Gchr22:50245033-0.156-0.128-0.041—   
chr22_50245049_G_Tchr22:502450490.154-0.013-0.182—   
chr22_50244793_G_Achr22:50244793-0.013-0.048-0.271—   
chr22_50244801_G_Achr22:502448010.037-0.053-0.271—   
chr22_50244852_G_Tchr22:50244852-0.007-0.038-0.271—   
chr22_50244856_G_Cchr22:502448560.0950.0690.271—   
chr22_50244877_G_Cchr22:502448770.0520.0000.271—   
chr22_50244918_C_Tchr22:50244918-0.0880.0840.271—   
chr22_50244982_G_Tchr22:502449820.0510.1710.271—   
chr22_50245046_C_Tchr22:50245046-0.127-0.077-0.271—   
chr22_50245047_C_Gchr22:50245047-0.135-0.078-0.271—   
chr22_50245047_C_Tchr22:50245047-0.136-0.105-0.271—   
chr22_50245061_G_Cchr22:502450610.1070.1040.271—   
chr22_50245087_G_Achr22:50245087-0.096-0.021-0.271—   
chr22_50245091_G_Tchr22:50245091-0.022-0.082-0.271—   
chr22_50245113_C_Achr22:50245113-0.054-0.171-0.271—   
chr22_50244877_G_Tchr22:502448770.1500.1020.259—   
chr22_50245042_C_Gchr22:50245042-0.148-0.098-0.265—   
chr22_50245044_C_Tchr22:50245044-0.142-0.119-0.265—   
chr22_50244791_G_Achr22:50244791-0.090-0.086-0.259—   
chr22_50244803_G_Achr22:50244803-0.043-0.074-0.259—   
chr22_50244891_A_Tchr22:502448910.1060.1420.259—   
chr22_50244913_T_Gchr22:50244913-0.032-0.027-0.259—   
chr22_50244963_G_Tchr22:502449630.1460.0520.129—   
chr22_50244991_G_Tchr22:502449910.1460.0700.024—   
chr22_50245008_A_Gchr22:502450080.081-0.102-0.259—   
chr22_50245045_G_Tchr22:50245045-0.078-0.084-0.259—   
chr22_50245084_T_Gchr22:502450840.049-0.0390.259—   
chr22_50245109_C_Tchr22:50245109-0.146-0.079-0.176—   
chr22_50244968_A_Cchr22:502449680.1440.0110.106—   
chr22_50244978_G_Achr22:502449780.1410.0670.059—   
chr22_50244787_G_Cchr22:50244787-0.047-0.096-0.247—   
chr22_50244803_G_Cchr22:50244803-0.045-0.069-0.247—   
chr22_50244806_C_Tchr22:50244806-0.042-0.041-0.247—   
chr22_50244863_G_Tchr22:50244863-0.057-0.086-0.247—   
chr22_50244867_C_Tchr22:502448670.1310.0840.247—   
chr22_50245003_G_Cchr22:502450030.062-0.119-0.247—   
chr22_50245007_C_Gchr22:50245007-0.006-0.0870.247—   
chr22_50245009_C_Achr22:502450090.014-0.054-0.247—   
chr22_50245051_A_Tchr22:50245051-0.068-0.047-0.241—   
chr22_50245082_A_Tchr22:50245082-0.136-0.0270.188—   
chr22_50245065_A_Tchr22:50245065-0.1360.001-0.188—   
chr22_50244963_G_Cchr22:502449630.1350.0440.129—   
chr22_50244984_C_Achr22:502449840.1350.016-0.082—   
chr22_50244790_C_Gchr22:502447900.0780.1040.235—   
chr22_50244791_G_Tchr22:50244791-0.050-0.063-0.235—   
chr22_50244794_C_Achr22:50244794-0.038-0.036-0.235—   
chr22_50244801_G_Tchr22:502448010.025-0.048-0.235—   
chr22_50244868_A_Tchr22:50244868-0.063-0.094-0.235—   
chr22_50244902_G_Cchr22:502449020.0650.0140.235—   
chr22_50244983_C_Achr22:502449830.0200.0880.235—   
chr22_50245007_C_Tchr22:502450070.115-0.105-0.235—   
chr22_50245070_G_Achr22:50245070-0.133-0.010-0.024—   
chr22_50245093_C_Gchr22:50245093-0.007-0.063-0.235—   
chr22_50245105_C_Gchr22:50245105-0.062-0.008-0.235—   
chr22_50245109_C_Gchr22:50245109-0.086-0.106-0.235—   
chr22_50245113_C_Tchr22:50245113-0.005-0.136-0.235—   
chr22_50245077_C_Gchr22:502450770.1320.1190.082—   
chr22_50244963_G_Achr22:502449630.1300.0470.106—   
chr22_50244993_C_Achr22:502449930.1290.0350.012—   
chr22_50245103_G_Tchr22:502451030.1290.0650.082—   
chr22_50244914_G_Achr22:502449140.1280.0610.129—   
chr22_50244860_A_Tchr22:50244860-0.063-0.099-0.224—   
chr22_50244866_C_Gchr22:50244866-0.063-0.109-0.224—   
chr22_50244874_A_Gchr22:50244874-0.025-0.051-0.224—   
chr22_50244899_G_Cchr22:502448990.0570.0330.224—   
chr22_50245004_C_Tchr22:502450040.058-0.077-0.224—   
chr22_50245028_A_Gchr22:502450280.0750.1090.224—   
chr22_50245042_C_Tchr22:50245042-0.126-0.034-0.159—   
chr22_50245090_A_Gchr22:50245090-0.048-0.054-0.224—   
chr22_50245092_G_Tchr22:50245092-0.025-0.025-0.224—   
chr22_50244858_A_Tchr22:502448580.1250.0480.094—   
chr22_50244915_G_Achr22:502449150.1230.0570.094—   
chr22_50244956_C_Gchr22:50244956-0.123-0.0090.035—   
chr22_50245060_C_Achr22:50245060-0.0920.017-0.218—   
chr22_50244791_G_Cchr22:502447910.008-0.033-0.212—   
chr22_50244793_G_Tchr22:50244793-0.013-0.043-0.212—   
chr22_50244864_T_Gchr22:50244864-0.052-0.051-0.212—   
chr22_50244865_G_Cchr22:502448650.005-0.071-0.212—   
chr22_50244865_G_Tchr22:50244865-0.010-0.081-0.212—   
chr22_50244881_T_Gchr22:50244881-0.003-0.041-0.212—   
chr22_50244900_G_Tchr22:502449000.0780.0330.212—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the p99-scaled [−1, 1] value; click a column to sort.