Home / Gene

ST3GAL5

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near ST3GAL5

chr2:85,737,119..85,989,034, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

VariantPosition PXR FXR AhR AF
chr2_85742016_T_Cchr2:8574201692,80030,49639,168—   
chr2_85741920_C_Gchr2:8574192072,44824,16033,792—   
chr2_85742044_T_Cchr2:8574204470,40014,56017,920—   
chr2_85742019_C_Achr2:8574201966,43224,09626,368—   
chr2_85741976_C_Gchr2:8574197662,84816,06428,160—   
chr2_85741939_T_Gchr2:85741939-54,528-19,616-27,136—   
chr2_85741939_T_Achr2:85741939-53,632-19,136-23,296—   
chr2_85741969_T_Cchr2:8574196953,63215,58423,296—   
chr2_85741920_C_Achr2:8574192051,58417,82423,040—   
chr2_85742016_T_Achr2:85742016-48,640-17,632-27,136—   
chr2_85741975_C_Gchr2:8574197547,2329,72824,064—   
chr2_85742006_G_Cchr2:8574200643,13617,88813,056—   
chr2_85741975_C_Tchr2:8574197541,0888,00019,200—   
chr2_85742020_A_Cchr2:8574202040,96015,2645,632—   
chr2_85741940_G_Tchr2:85741940-39,552-17,120-16,896—   
chr2_85742036_G_Tchr2:85742036-38,912-14,464-21,504—   
chr2_85741929_G_Cchr2:85741929-38,784-13,696-17,152—   
chr2_85742013_T_Gchr2:85742013-38,144-12,512-18,176—   
chr2_85741932_C_Tchr2:85741932-38,016-15,872-17,664—   
chr2_85741899_T_Achr2:8574189937,88815,61628,672—   
chr2_85741931_C_Gchr2:85741931-36,864-13,504-16,128—   
chr2_85741972_C_Achr2:8574197235,45614,0489,472—   
chr2_85741936_G_Tchr2:85741936-35,200-11,392-14,080—   
chr2_85741941_A_Cchr2:85741941-35,200-13,056-16,896—   
chr2_85741992_C_Gchr2:8574199235,0726,33615,360—   
chr2_85741929_G_Tchr2:85741929-34,688-12,576-14,592—   
chr2_85741941_A_Gchr2:85741941-34,688-13,056-13,568—   
chr2_85741941_A_Tchr2:85741941-34,688-13,792-15,104—   
chr2_85741976_C_Achr2:8574197634,6886,75215,616—   
chr2_85741934_T_Achr2:85741934-34,560-13,984-14,592—   
chr2_85741873_G_Tchr2:85741873-33,536-12,608-21,248—   
chr2_85741944_C_Achr2:85741944-33,536-15,136-5,888—   
chr2_85741932_C_Achr2:85741932-33,152-13,632-13,824—   
chr2_85741942_C_Gchr2:85741942-32,384-14,560-11,008—   
chr2_85742018_A_Cchr2:85742018-32,128-13,440-16,640—   
chr2_85741940_G_Cchr2:85741940-32,000-14,176-10,752—   
chr2_85741974_C_Gchr2:8574197431,8725,63217,152—   
chr2_85742017_G_Tchr2:85742017-31,744-10,656-19,456—   
chr2_85741896_C_Achr2:8574189630,97610,20810,240—   
chr2_85742017_G_Achr2:85742017-30,976-11,488-22,528—   
chr2_85741873_G_Cchr2:85741873-30,720-12,672-16,640—   
chr2_85742020_A_Tchr2:85742020-30,720-10,912-16,896—   
chr2_85741928_C_Gchr2:85741928-30,336-12,416-11,264—   
chr2_85741929_G_Achr2:85741929-30,336-11,200-13,312—   
chr2_85741933_T_Achr2:85741933-30,336-11,968-12,032—   
chr2_85741961_C_Gchr2:85741961-29,952-7,616-15,104—   
chr2_85741978_C_Achr2:85741978-29,952-11,968-13,056—   
chr2_85742019_C_Tchr2:85742019-29,952-8,192-16,896—   
chr2_85742024_T_Gchr2:8574202429,9528,22410,496—   
chr2_85741914_C_Gchr2:8574191429,44012,16018,432—   
chr2_85741943_C_Gchr2:85741943-29,440-12,448-8,448—   
chr2_85741943_C_Tchr2:85741943-29,184-13,024-11,520—   
chr2_85741931_C_Achr2:8574193128,8007,3289,472—   
chr2_85741990_T_Achr2:85741990-28,672-9,344-12,032—   
chr2_85741931_C_Tchr2:85741931-28,416-10,624-13,312—   
chr2_85742046_T_Achr2:8574204628,4167,36012,032—   
chr2_85741898_C_Gchr2:8574189828,28811,96817,920—   
chr2_85742009_T_Achr2:8574200928,1607,87212,032—   
chr2_85741932_C_Gchr2:85741932-28,032-11,904-11,008—   
chr2_85741879_C_Tchr2:8574187927,7768,9608,192—   
chr2_85741935_T_Cchr2:85741935-27,776-11,424-12,032—   
chr2_85742019_C_Gchr2:85742019-27,648-7,744-16,640—   
chr2_85741899_T_Gchr2:8574189927,52012,22424,832—   
chr2_85741872_T_Achr2:85741872-27,264-10,688-6,912—   
chr2_85741939_T_Cchr2:85741939-27,264-10,688-12,800—   
chr2_85742013_T_Cchr2:85742013-27,264-8,992-12,288—   
chr2_85741856_A_Tchr2:8574185627,0089,8889,728—   
chr2_85741869_G_Achr2:8574186926,8807,20011,008—   
chr2_85741943_C_Achr2:85741943-26,880-12,448-11,008—   
chr2_85741946_A_Cchr2:85741946-26,624-8,640-11,520—   
chr2_85742014_T_Achr2:85742014-26,624-10,272-11,776—   
chr2_85741889_C_Tchr2:8574188926,3689,05615,104—   
chr2_85741998_C_Gchr2:8574199826,2406,65610,240—   
chr2_85741913_C_Gchr2:8574191326,1129,85616,640—   
chr2_85741933_T_Gchr2:85741933-26,112-10,336-9,728—   
chr2_85741974_C_Tchr2:8574197425,9843,32813,824—   
chr2_85742013_T_Achr2:85742013-25,984-9,344-9,472—   
chr2_85741984_G_Tchr2:85741984-25,856-9,152-12,032—   
chr2_85741873_G_Achr2:85741873-25,728-10,528-13,824—   
chr2_85741876_C_Achr2:85741876-25,600-10,848-11,520—   
chr2_85741876_C_Tchr2:85741876-25,472-10,976-11,776—   
chr2_85742015_A_Cchr2:85742015-25,472-9,184-16,128—   
chr2_85741928_C_Achr2:85741928-25,216-10,240-8,704—   
chr2_85741977_C_Gchr2:8574197725,0884,86410,496—   
chr2_85741876_C_Gchr2:85741876-24,704-10,432-9,216—   
chr2_85741975_C_Achr2:85741975-24,704-12,064-9,728—   
chr2_85741855_G_Tchr2:8574185524,4487,9686,912—   
chr2_85741934_T_Gchr2:85741934-24,448-10,400-8,960—   
chr2_85742001_C_Gchr2:8574200124,1923,6489,216—   
chr2_85741874_A_Cchr2:85741874-24,064-9,952-8,960—   
chr2_85741960_G_Cchr2:8574196023,8088,3849,728—   
chr2_85741985_G_Cchr2:85741985-23,808-8,544-19,456—   
chr2_85741986_C_Achr2:85741986-23,808-8,928-12,288—   
chr2_85741987_C_Gchr2:85741987-23,552-8,992-9,728—   
chr2_85741935_T_Achr2:85741935-23,168-8,608-8,960—   
chr2_85742000_G_Cchr2:85742000-22,912-6,944-16,896—   
chr2_85742012_G_Tchr2:85742012-22,656-7,808-10,752—   
chr2_85741942_C_Tchr2:85741942-22,528-11,200-8,448—   
chr2_85742020_A_Gchr2:85742020-22,528-9,056-9,216—   
chr2_85741870_G_Achr2:8574187022,2725,4087,936—   
chr2_85741883_A_Cchr2:8574188322,2726,7848,448—   
chr2_85741836_C_Gchr2:8574183622,14411,32810,752—   
chr2_85741895_G_Achr2:8574189522,0166,9123,328—   
chr2_85742015_A_Gchr2:8574201522,0166,8489,216—   
chr2_85741978_C_Gchr2:85741978-21,504-8,704-7,936—   
chr2_85741901_G_Cchr2:85741901-21,376-9,472-15,104—   
chr2_85741974_C_Achr2:8574197421,37651212,800—   
chr2_85742018_A_Gchr2:85742018-21,120-9,824-12,544—   
chr2_85741924_C_Gchr2:85741924-20,992-7,648-8,960—   
chr2_85741901_G_Achr2:85741901-20,864-9,728-15,616—   
chr2_85741880_G_Tchr2:85741880-20,736-8,640-8,448—   
chr2_85741871_C_Tchr2:8574187120,4807,2966,144—   
chr2_85741991_C_Achr2:85741991-20,480-8,800-10,496—   
chr2_85741866_G_Cchr2:8574186620,3524,8008,448—   
chr2_85741971_G_Cchr2:8574197120,3526,5608,448—   
chr2_85741905_C_Tchr2:85741905-20,096-9,152-15,616—   
chr2_85741877_T_Gchr2:85741877-19,968-7,744-6,912—   
chr2_85741940_G_Achr2:85741940-19,968-10,048-6,656—   
chr2_85741875_C_Tchr2:85741875-19,712-7,616-9,216—   
chr2_85741877_T_Achr2:85741877-19,712-7,744-7,680—   
chr2_85741898_C_Tchr2:8574189819,5846,6564,096—   
chr2_85741900_T_Cchr2:85741900-19,584-10,784-12,544—   
chr2_85741837_A_Gchr2:8574183719,45610,17616,384—   
chr2_85741945_C_Achr2:85741945-19,456-6,656-4,864—   
chr2_85741902_A_Tchr2:85741902-19,328-10,048-13,568—   
chr2_85741961_C_Tchr2:85741961-19,328-9,024-10,240—   
chr2_85741872_T_Gchr2:85741872-19,072-5,312-256—   
chr2_85741882_C_Achr2:8574188219,0725,8566,400—   
chr2_85741966_G_Tchr2:85741966-19,072-6,176-10,240—   
chr2_85741936_G_Cchr2:85741936-18,688-5,536-7,936—   
chr2_85742017_G_Cchr2:85742017-18,560-7,584-19,456—   
chr2_85741912_C_Gchr2:8574191218,5605,3126,400—   
chr2_85742040_T_Cchr2:8574204018,5607,00812,288—   
chr2_85741884_T_Cchr2:8574188418,4325,0568,704—   
chr2_85741869_G_Tchr2:8574186918,3044,0966,656—   
chr2_85741903_C_Tchr2:85741903-18,176-8,928-14,080—   
chr2_85741956_C_Gchr2:85741956-18,176-4,384-7,680—   
chr2_85741872_T_Cchr2:85741872-18,048-5,696-3,840—   
chr2_85741911_T_Cchr2:85741911-18,048-7,168-13,568—   
chr2_85741903_C_Achr2:85741903-17,536-8,384-12,800—   
chr2_85742014_T_Cchr2:85742014-17,536-6,208-11,520—   
chr2_85741878_T_Gchr2:85741878-17,408-7,360-5,888—   
chr2_85741958_G_Tchr2:8574195817,4084,3846,400—   
chr2_85741875_C_Gchr2:85741875-17,280-6,784-5,632—   
chr2_85741977_C_Achr2:8574197717,2802,4326,656—   
chr2_85742010_G_Cchr2:85742010-17,280-6,176-8,192—   
chr2_85741915_C_Gchr2:8574191517,0247,0729,984—   
chr2_85741984_G_Achr2:85741984-17,024-5,600-8,192—   
chr2_85741988_C_Achr2:85741988-17,024-6,080-7,424—   
chr2_85742012_G_Achr2:8574201216,8967,16813,056—   
chr2_85742025_T_Gchr2:85742025-16,896-7,456-6,912—   
chr2_85741971_G_Tchr2:8574197116,7684,8648,192—   
chr2_85741997_G_Tchr2:8574199716,7689,6007,168—   
chr2_85742034_C_Gchr2:85742034-16,768-5,920-8,704—   
chr2_85741968_C_Gchr2:85741968-16,640-4,992-6,400—   
chr2_85741914_C_Tchr2:8574191416,5127,07210,752—   
chr2_85741906_A_Tchr2:85741906-16,384-9,344-13,568—   
chr2_85741989_G_Cchr2:8574198916,3845,3443,328—   
chr2_85742000_G_Achr2:85742000-16,384-5,600-2,560—   
chr2_85741914_C_Achr2:8574191416,2567,07211,008—   
chr2_85741944_C_Gchr2:85741944-16,256-9,728-768—   
chr2_85741868_G_Tchr2:8574186816,1284,2566,400—   
chr2_85741900_T_Achr2:85741900-16,128-9,984-12,800—   
chr2_85741927_C_Gchr2:8574192715,8727,68010,752—   
chr2_85741880_G_Achr2:85741880-15,744-6,304-7,680—   
chr2_85741988_C_Gchr2:85741988-15,616-6,784-6,400—   
chr2_85741937_C_Tchr2:85741937-15,488-5,184-7,936—   
chr2_85741951_C_Gchr2:85741951-15,488-4,192-7,424—   
chr2_85741877_T_Cchr2:85741877-15,360-5,632-6,144—   
chr2_85741978_C_Tchr2:85741978-15,360-6,912-6,912—   
chr2_85741996_T_Cchr2:85741996-15,360-4,672-9,984—   
chr2_85741868_G_Achr2:8574186815,2324,3847,936—   
chr2_85741907_C_Achr2:85741907-15,232-7,232-13,312—   
chr2_85741911_T_Achr2:85741911-15,232-7,616-10,240—   
chr2_85741969_T_Achr2:8574196915,2324,3849,216—   
chr2_85741835_C_Tchr2:8574183515,1045,4089,472—   
chr2_85741890_G_Cchr2:85741890-14,976-7,104-9,984—   
chr2_85742025_T_Achr2:85742025-14,976-5,824-5,888—   
chr2_85741858_C_Gchr2:8574185814,8487,9048,448—   
chr2_85741930_G_Achr2:8574193014,8488,6403,584—   
chr2_85741956_C_Achr2:85741956-14,720-4,992-6,144—   
chr2_85741960_G_Achr2:8574196014,7204,8643,328—   
chr2_85741984_G_Cchr2:85741984-14,720-5,216-5,376—   
chr2_85742006_G_Tchr2:8574200614,5925,7606,144—   
chr2_85741896_C_Tchr2:85741896-14,464-5,920-6,144—   
chr2_85741906_A_Gchr2:85741906-14,464-7,808-10,496—   
chr2_85741987_C_Tchr2:85741987-14,464-5,216-6,656—   
chr2_85741874_A_Tchr2:85741874-14,336-6,176-5,376—   
chr2_85741925_A_Cchr2:85741925-14,336-3,968-10,752—   
chr2_85741927_C_Achr2:8574192714,3367,71210,240—   
chr2_85741913_C_Tchr2:8574191314,2085,7609,728—   
chr2_85741871_C_Achr2:8574187114,0804,5123,328—   
chr2_85741987_C_Achr2:85741987-14,080-6,592-3,072—   
chr2_85741836_C_Tchr2:8574183613,9524,8328,448—   
chr2_85741880_G_Cchr2:85741880-13,952-4,160-1,792—   
chr2_85741901_G_Tchr2:85741901-13,952-6,624-11,520—   
chr2_85741952_A_Gchr2:8574195213,9526,5286,400—   
chr2_85741912_C_Tchr2:8574191213,4407,00814,080—   
chr2_85741926_C_Tchr2:8574192611,64810,46415,104—   
chr2_85742023_T_Achr2:857420234,60816020,224—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the raw center bin Δ, ALT minus REF; click a column to sort.